Για τη διακόσμηση του ενυδρείου, χρησιμοποιούνται, με επιτυχία, διάφορα φυσικά υλικά π.χ. πέτρες, ξύλα, ρίζες από άγρια πεύκι, καθώς επίσης και βέργες μπαμπού.
Μεγάλη σημασία για το ενυδρείο έχουν οι πέτρινες κατασκευές, όπως οι σπηλιές, οι διάφορες κοιλότητες, οι ταράτσες κλπ.
Βασικά, είναι κατάλληλες οι πέτρες που δεν σκληραίνουν το νερό, δηλαδή όσες δεν προέρχονται από ασβεστούχα πετρώματα. Κατάλληλα πετρώματα είναι τα γρανιτικά, τα ηφαιστειογενή καθώς και ο βασάλτης και ο σχιστόλιθος. Στρωσιγενή η αμμώδη πετρώματα, θα έπρεπε να εξεταστούν πρώτα αν είναι κατάλληλα. Με το τεστ του υδροχλωρικού οξέως μπορείτε να βεβαιωθείτε για την περιεκτικότητα τους σε ασβέστιο.
Οι ρίζες άγριας πεύκης, είναι πολύ διακοσμητικές. Οι ρίζες αυτές δεν σαπίζουν στο νερό και είναι πραγματικά το κάτι άλλο για το ενυδρείο. Εάν δεν μπορείτε να βρείτε ο ίδιος, σε ελώδη εδάφη, τέτοιες ρίζες, μπορείτε να τις αγοράσετε από τα ειδικά μαγαζιά. Είναι πιθανόν, όμως, οι ρίζες αυτές να μην είναι απόλυτα κονσερβοποιημένες και κάποια στιγμή να αρχίσουν να σαπίζουν, η να μουχλιάζουν. Αυτές πρέπει να απομακρυνθούν αμέσως από το ενυδρείο.
Προτού βυθίσουμε τις ρίζες στο νερό του ενυδρείου μας, πρέπει να τις καθαρίσουμε, να τις ξύσουμε και να τις μουσκέψουμε καλά. Επειδή είναι ξεραμένες, χρειάζονται αρκετό χρόνο, μέχρι να απορροφήσουν τόσο νερό ώστε να βουλιάξουν μόνες τους. Λίγο βράσιμο επιταχύνει την όλη διαδικασία.
Εάν δεν βουλιάζουν μόνες τους, τις δένουμε με τις πέτρες, η τις κολλάμε με μείγμα σιλικόνης και καουτσούκ η ακόμη τις βιδώνουμε, με ανοξείδωτες βίδες πάνω σε συνθετικές πλάκες, και μετά τοποθετούμε την επίστρωση πάνω από τη συνθετική πλάκα.
Οι μεγάλες ρίζες κάνουν το μαλακό νερό όξινο. Επηρεάζουν δηλαδή το δείκτη pH του νερού θετικά. Πάντως, τις πρώτες βδομάδες θα πρέπει να ελέγχουμε συχνά το δείκτη pH .
Επίσης, μπορούμε να αγοράσουμε από τα ειδικά μαγαζιά ξύλινα απολιθώματα που έχουν ήδη καθαριστεί με αμμοβολή και είναι πολύ εντυπωσιακό άλλα και πολύ ακριβά.
Σπηλιές για μικρά ψάρια μπορούμε να φτιάξουμε μόνοι μας από μια φοινικοκαρύδα. Αφού κάνουμε μια μικρή τρύπα, βγάζουμε προσεχτικά τη σάρκα και στη συνέχεια τη βράζουμε. Η σπηλιά είναι έτοιμη. Την καρύδα, τη μισογεμίζουμε με άμμο και τη θάβουμε στο βυθό, έτσι ώστε να φαίνεται μόνο το άνοιγμα εισόδου. Τέτοιες σπηλιές είναι πολύ αγαπητές στα Pelvicachromis Pulcher.
Όμως, και οι μικρές γλάστρες είναι κατάλληλες για σπηλιές. Βέβαια, πρέπει να σπάσουμε ένα κομματάκι δημιουργώντας έτσι την είσοδο.
Στην πραγματικότητα, όλα τα φυσικά υλικά, εάν δεν σαπίζουν και δεν αποβάλλουν δηλητηριώδεις ουσίες, είναι κατάλληλα για τη διακόσμηση του ενυδρείου μας. Τα ειδικά μαγαζιά προσφέρουν μια πληθώρα από προκατασκευασμένα υλικά διακόσμησης, από τα φτηνά πλαστικά μέχρι το περιβόητο βυθισμένο καραβάκι με το δύτη.